木材利用ポイントの申請方法は、住宅エコポイントや復興支援住宅エコポイントなどと同じような方法になります。
住宅を購入、また木質化工事をした家主自らか、工事発注者などが行います。
申請書類を窓口にもっていくか、郵送することでポイントを商品に交換することが可能になります。

木材利用ポイントは、従来の住宅のポイント制度と条件の違いはあってもほとんど同じような特典をもらうことのできる仕組みになっています。

木材を利用した地域の農林水産物など。
農山漁村などに体験型旅行に行けるサービス。
全国で使用できる商品券やプリペイドカードや、地域で使用できる商品券。
農林水産関連の商品券。
森林づくりや木をつくる活動に対する寄付。
被災地などへの寄付。

これらのものが木材利用ポイントの交換対象になります。
他にも、即時交換というものがあります。
この即時交換では、木材利用ポイントの対象となる工事に地域材以外の別の木材などを使用した追加工事などの代金にポイントを使用することができます。

全国商品券やプリペイドカードなどへの交換や即時交換の場合、使用制限があります。
もらったポイントの最大50％になります。
基本的に30万ポイントがポイント付与の限度となるので、15ポイント程度になります。
住宅エコポイントや、復興支援住宅エコポイントのように、木材利用ポイントでもこのようなものに交換することができるのです。

そのことにしたがうと、木造の新築住宅の場合考えて地域材を使用することで最高60万ポイントが加算されるのです。
主要小僧だけでなく、床や壁にも地域材をふんだんに使用することで獲得ポイントは多くなります。

木造住宅を新築で建てる場合や増築する場合購入する場合のポイントは一棟あたり30万ポイントになります。
東日本大震災などの被災地に至っては、一棟で最大50万ポイントも獲得することができます。
住宅の床や壁などを木材に変える木質工事の場合は、以下のような工法が当てはまります。
木質化工事に行われる床や内壁などは、一棟あたりそれぞれ9㎡以上になります。
外壁などは、一棟あたり10㎡以上の木質化工事を行うことが条件となります。
これらのポイントの合計の上限は30ポイントになります。