Installing scipy in a virtual environment should be initially quite straightforward:

python virtualenv.py myVE
source myVE/bin/activate
pip install scipy

However, during the installation of scipy I found the following three problems that took me several hours to solve. Here I share the solutions that worked for me in case they can be useful for someone else (specially myself in the future).

ImportError: libatlas.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory
This error appears even having Atlas library properly installed. Apparently, it’s an error that only happens with numpy 1.9.2 in a virtual environment as I found in a small comment in Stack Overflow. The solution is to install the previous version:

pip install numpy==1.9.1

error: library dfftpack has Fortran sources but no Fortran compiler found
Despite my system had 3 different versions of gfortran, none of them were found by the installer. The solution is to create a symbolic link and then include it in your PATH variable.

ln -s /usr/bin/gfortran-4.7 ~/bin/gfortran
export PATH=$PATH:~/bin

ImportError: libopenblas.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory
In this case, OpenBLAS library was not installed in the system, so the solution was to compile and install it manually. You can get the sources in the OpenBLAS website and then follow the installation guide.

make
make PREFIX=~/openblas install
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:~/openblas/lib
export PATH=$PATH:~/openblas/bin

El artículo Installing scipy in a Python virtual environment pertenece al blog The Power of Mind.

Julio

Durante los meses de verano seguimos viviendo en Alemania. Aquí muestro algunos álbums de fotos de aquella estancia. También, a mediados de julio pasé el examen oral a mitad del doctorado, por lo que pude continuar con mi investigación.

Bonn

Köln

Red Bull Seifenkisten Rennen Herten 2013

Agosto

Nos tomamos unos días de vacaciones en Granada. En esta foto estoy cual guiri en las ruinas de la antigua factoría de salazón de Almuñecar, con el castillo de San Miguel al fondo.

Septiembre

Siegen y Freudenberg

Amsterdam

Octubre

27º Cumpleaños

Noviembre

Ganamos el premio a la idea más innovadora de la Agencia Espacial Europea (ESA).

Jubilo a mi ZTE Blade y paso a tener el Motorola Moto G, con el que sigo muy contento desde entonces.

Diciembre

Intentamos mejorar la Marca España a base de tortilla de patatas y turrón de chocolate en un día internacional organizado por la universidad.

Epílogo

• Canción del año: Get Lucky (Daft Punk)
• Película del año: Gravity
• Serie del año: Los Soprano
• Videojuego del año: Lego Batman 1 y 2 (DC Super Heroes)
• Videojuego Android del año: Plants vs Zombies 2

Espero tardar menos en escribir el resumen de 2014 :)

El artículo Adiós 2013. Hola 2014. (Parte 2) pertenece al blog The Power of Mind.

Enero

Nieve en Bournemouth

Ringwood Brewery

Febrero

Año nuevo chino 2013

Marzo

Londres

Abril

Barcelona

Mayo

Diez años entre la blogosfera y twitter: ilustrando una noticia en el diario local de Granada.

Junio

Nos mudamos a Marl, una pequeña ciudad en el oeste de Alemania, donde pasamos 4 meses mientras trabajaba en el parque químico.

Continuará…

El artículo Adiós 2013. Hola 2014. (Parte 1) pertenece al blog The Power of Mind.

I have been looking for a Java implementation of Robust PCA, but unfortunately I couldn’t find any. Luckily, I came upon an R implementation available in rrcov package. My initial plan was to translate this method to Java language, but it was going to take a lot of time. Therefore, I developed a Java wrapper that connects with R interface using JRI library, which is included in rJava package (a low-level R to Java interface). You can get the code here: RobustPCA.java (mirror).

If you are looking for a Robust PCA Matlab implementation you can get the code of LIBRA project, a Matlab library for robust analysis, but I encourage you to use R instead for a number of reasons.

Image: Copyright by Matthias Scholz

El artículo Robust PCA in Java using R pertenece al blog The Power of Mind.

Las especificaciones hardware las podéis encontrar en la web oficial y en GSMArena. Lo primero que destacaría es la pantalla IPS de 4.5 pulgadas y una resolución de 326ppi (igual densidad de pixels que la del iPhone 5s por poner un ejemplo). La CPU es un quad-core 1.2 GHz Cortex-A7 y la GPU es Adreno 305, que junto con 1GB de memoria RAM hacen que el terminal vaya muy fluído. Algunos puntos débiles que mencionar son la cámara (la calidad deja algo que desear, pero suficiente para el día a día), la batería no extraíble y la falta de ranura para tarjetas SD.

En cuanto al software, viene por defecto Android 4.3 (Jelly Bean) sin modificaciones pero ya lo están actualizando a Android 4.4.2 (KitKat). Cabe destacar que Motorola ha liberado el kernel del teléfono y está disponible para descargar en Sourceforge. Todavía no hay una versión oficial de Cyanogen para Moto G, pero podéis encontrar la ROM no oficial en el foro de xda-developers junto con mucha más información.

En mi opinión, la relación calidad/precio es inmejorable y si buscas un teléfono por menos de 200€ sin duda recomendaría el Moto G.

El artículo Motorola Moto G: primeras impresiones pertenece al blog The Power of Mind.

wget https://download.oracle.com/berkeley-db/db-4.8.30.tar.gz
tar xvzf db-4.8.30.tar.gz
cd db-4.8.30
cd build_unix/
../dist/configure --prefix=$YOUR_APP_FOLDER/berkleydb
make
make install

Once the Berkley DB library is installed, we can proceed to install OpenLDAP indicating the correct paths.

wget ftp://ftp.openldap.org/pub/OpenLDAP/openldap-release/openldap-2.4.38.tgz
tar xvzf openldap-2.4.38.tgz
cd openldap-2.4.38
export LD_LIBRARY_PATH=$YOUR_APP_FOLDER/berkleydb/lib/:$LD_LIBRARY_PATH
LDFLAGS=-L$YOUR_APP_FOLDER/berkleydb/lib CPPFLAGS="-D_GNU_SOURCE -I$YOUR_APP_FOLDER/berkleydb/include" ./configure --prefix=$YOUR_APP_FOLDER/openldap
make depend
make install

Finally, if we want to install also python-ldap library using pip we will find that the installation fails. For solving this issue, we have to indicate where OpenLDAP is located. If we are using a virtual environment (if not, you should!), we have to edit the following lines in the file $YOUR_VIRTUALENV_FOLDER/build/python-ldap/setup.cfg as explained by eikonomega.

[_ldap]
library_dirs = $YOUR_WEBAPP_FOLDER/openldap/lib /usr/lib64 /usr/lib
include_dirs = $YOUR_WEBAPP_FOLDER/openldap/include /usr/include/sasl /usr/include

I hope you find this post useful. Beware that installation steps may vary depending on your linux server and software versions.

El artículo Installing OpenLDAP in a Webfaction server pertenece al blog The Power of Mind.

A nivel de usuario con unos requisitos de espacio no muy elevados, podemos encontrar muchos servicios gratuitos tales como:

• Dropbox: este es el líder del sector. Dispone tanto de versión web como diversos clientes para distintos sistemas operativos. La versión gratuita ofrece entre 2 y 18GB, aunque yo dispongo de casi 35GB por acumular diversas promociones.
• Box: la versión gratuita nos ofrece 5GB de espacio y limita el tamaño máximo de archivo a 250MB. Sin embargo no tiene un cliente de escritorio, aunque sí podemos acceder vía web y con dispositivos móviles Android e iOS.
• Google Drive: Google nos ofrece 15GB de almacenamiento a compartir entre Drive, Gmail y Photos. Dispone de un cliente de escritorio para Windows y Mac. Además, podemos editar nuestros archivos online con lo que antes conocíamos como Google Docs.
• Ubuntu One: es el servicio de almacenamiento en la nube de Canonical, la empresa que está detrás de Ubuntu. Empecé a usarlo en sus versiones iniciales, pero debido a diversos problemas lo dejé de lado. Si bien el ciente está escrito en Python y es software libre y multiplataforma, la parte del servidor es propietaria.
• Mega: es el sucesor del polémico MegaUpload. Ofrece 50GB en su paquete gratuito. Está aún en una fase temprana ya que fue lanzado a principios de año. Dispone de una API para desarrolladores pero no existe aplicaciones lo suficientemente buenas para sincronizar nuestros archivos.

Todos estos servicios ofrecen alojamiento y funcionalidades extras si estamos dispuestos a pagar una cuota mensual.

Por otro lado, si lo que queremos es gestionar y almacenar con seguridad los documentos de una empresa los servicios anteriores también ofrecen paquetes más avanzados.

• Dropbox: permite ampliar el almacenamiento todo lo que se necesite. Dispone de ciertos aspectos extra de seguridad, así como herramientas de administración. También ofrece soporte telefónico.
• Box: dispone de un servicio para empresas de hasta 500 usuarios y otro para empresas aún mayores donde podemos contratar espacio ilimitado. Estas versiones empresariales tienen como valor añadido herramientas de colaboración, administración y seguridad que no están disponibles en versiones inferiores.
• Google Drive: si nos limitamos a ver la opción de almacenamiento de Google Apps para empresas resulta curioso que la versión básica solo ofrezca 5GB por usuario, que podremos ampliar hasta 16TB previo pago. Sin embargo, incluye opciones de administración adicionales y podemos tener un control total de los mensajes de correo nuestra empresa.

Ubuntu One y Mega no tienen versión empresarial, pero sí ofrecen paquetes de pago con espacio adicional de hasta 20GB y 4TB respectivamente.

Quiero destacar también que los servicios de alojamiento fotográfico están dando grandes pasos para atraer a más público como ha hecho Flickr recientemente al ofrecer 1TB de espacio gratuito.

El artículo Almacenamiento en la nube a nivel de usuario y empresarial pertenece al blog The Power of Mind.

En el último evento para desarrolladores de Google han renovado este sistema que a partir de ahora pasa a llamarse Hangouts. Con ello intentan unificar la interfaz de usuario y que además estén sincronizados los mensajes entre los diferentes clientes. Uno de los cambios más significativos es que se han desecho del protocolo XMPP, por lo que ahora no podemos utilizar clientes externos a Google. El nuevo protocolo cerrado de Google tampoco permite diferentes estados (Disponible, Ocupado, Invisible, Desconectado, etc.). Simplemente podemos elegir entre estar conectado o no estarlo. De hecho, si tienes la aplicación Hangout para Android estarás por defecto siempre conectado.

Personalmente, tras estar probándolo durante unas semanas he decidido volver al antiguo Google Talk mientras se encuentre operativo. Una de las cosas que especialmente me molestaba es que cuando conectaba mi teléfono a Internet recibía las notificaciones de conversaciones antiguas como si fueran nuevas. Pienso que una empresa de la envergadura de Google podría haberlo hecho mejor. Sin embargo tampoco tenemos derecho a quejarnos demasiado ya que se trata de un servicio gratuito (por lo que nosotros somos el producto) y si no nos gusta siempre podemos migrar a otras alternativas para comunicarnos.

El artículo Google Hangouts: o cómo empeorar un buen servicio pertenece al blog The Power of Mind.

Feedly lleva desde 2008 funcionando con relativo éxito, pero ha sido ahora cuando ha crecido exponencialmente. En cuestión de dos semanas han recibido a 3 millones de usuarios (o refugiados, como nos llaman ellos). Desde el anuncio de cierre de Google Reader, en el blog de Feedly prepararon un post para facilitar la migración y actualizaron sus servidores de una manera ejemplar para que no se viese mermado el servicio.

De momento seguiré usando Feedly, pero cuando este servicio desaparezca, siempre tendremos alternativas libres como TT-RSS que podremos instalar en nuestro propio servidor sin depender de una empresa externa.

El artículo Feedly o cómo gestionar bien una oportunidad pertenece al blog The Power of Mind.

El artículo 900.000 km de cable submarino pertenece al blog The Power of Mind.